牡丹扦插繁殖成活率低，生根量小，生长势弱，养护管理难度大，因此生产上几乎不采用。
    扦插繁殖的最佳时间为9月上旬(白露)到9月下旬(秋分)，这时气温为18-25℃，地温18－23℃，只要插床基质墒情适中，7－10天可以形成愈伤组织，插后50－ 60天，可以长出4-10条新根，但新根短、细、嫩。到12月份时，根部基本停止生长。扦插时，插穗要选取粗壮无病虫害的，地表处的萌蘖枝做插穗更易生根。每个插穗长5-10cm，用500-800mg/L的吲哚丁酸、ABT1号生根粉等生根剂速蘸，然后以株行距10×20cm插入基质中，插入深度为插穗长的1/2－2/3，压实基质，保持湿润。牡丹扦插繁殖的成活率一般不超过60%，主要原因是扦插后当年新生根少而短，无法满足植株生长所需的足够的水分和营养，从而造成死亡。牡丹扦插成活两年后，可以移栽到大田定植。
    对于粗壮充实的良种枝条，采用嫁接的方法较之扦插，其成活率肯定更高。但是，在3月下旬(春分)，为调节枝条生长势及植株整形，许多长约5-10cm 的萌蘖嫩枝都被掰去舍弃，殊为可惜。如果能将其用以扦插，将是弃物利用增加苗木产量的途径，这是摆在牡丹科研工作者面前的一个重要课题。